Космический воин Зеро

После долгих лет войны между человечеством и разумными машинами, известными как механоиды, наступило время перемирия. Земля, почти полностью захваченная механоидами, теперь находится под их контролем, и обе стороны, с трудом, но принимают этот факт. Зеро, бывший адмирал человеческой флота в Великой Галактической войне, теперь капитан буксирного судна, продолжает свою борьбу за Землю, несмотря на личные потери.

Во время одного из буксирных рейсов Зеро сталкивается с атакой таинственного пиратского корабля, известного как «Тень смерти». Несмотря на героические усилия, Зеро терпит поражение. Вскоре ему поручают миссию по захвату легендарного пирата капитана Харлока, который оказывается тем самым нападавшим.

Под флагом Независимого Флота, Зеро, вместе со своим бывшим военным линкором «Кария» и разношёрстной командой из механоидов и людей, отправляется в путешествие по галактике. Их цель — найти и остановить капитана Харлока, чьи действия угрожают новому миру, сложившемуся после войны.