В аниме-сериале «Полифоника» действие происходит на магическом континенте, где мир людей и духов гармонично переплетается благодаря божественной музыке, которую могут исполнять только особые музыканты — дэнтисты. Сюжет вращается вокруг юноши Форона Татары, его учебы в Академии Божественной Музыки и первых шагов в понимании искусства взаимодействия с духами.
Форон, вместе со своим сокурсником Кортикарте, начинает свой путь в изучении тайн музыки, которая связывает миры. Их дружба и соперничество становятся ключом к раскрытию глубинных секретов академии и самой музыки, которая является не только источником гармонии, но и мощным оружием в руках тех, кто способен ею управлять.
Однако, даже в этом удивительном мире, где музыка является средством общения с духами, существуют темные силы. Террористы, стремящиеся к разрушению и страху, угрожают мирной жизни Полифоники. Форон и Кортикарте должны не только научиться управлять своим новым даром, но и противостоять этим мрачным силам, чтобы защитить тех, кого они любят.